Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIM21P19474 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms