Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA1P17302 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA1P17302 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA1P17302 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA1P17302 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA1P17302 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA1P17302 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA1P17302 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA1P17302 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA1P17302 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA1P17302 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA1P17302 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA1P17302 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms