Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMP3P12645 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMP3P12645 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BMP3P12645 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BMP3P12645 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BMP3P12645 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BMP3P12645 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BMP3P12645 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BMP3P12645 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BMP3P12645 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BMP3P12645 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BMP3P12645 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMP3P12645 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms