Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TPRP12270 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TPRP12270 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
TPRP12270 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
TPRP12270 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.07
TPRP12270 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
TPRP12270 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.07
TPRP12270 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
TPRP12270 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
TPRP12270 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TPRP12270 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TPRP12270 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPRP12270 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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