Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODC1P11926 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODC1P11926 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODC1P11926 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms