Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTHFD1P11586 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms