Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMC1P11047 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
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