Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBSLP0DN79 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms