Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms