Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PRAMEF10O60809 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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PRAMEF10O60809 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PRAMEF10O60809 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PRAMEF10O60809 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PRAMEF10O60809 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PRAMEF10O60809 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PRAMEF10O60809 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF10O60809 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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