Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms