Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAK2O60296 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAK2O60296 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms