Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCAO15360 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCAO15360 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCAO15360 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCAO15360 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCAO15360 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCAO15360 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCAO15360 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCAO15360 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCAO15360 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCAO15360 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCAO15360 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCAO15360 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCAO15360 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCAO15360 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCAO15360 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCAO15360 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCAO15360 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCAO15360 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCAO15360 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCAO15360 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCAO15360 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCAO15360 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCAO15360 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCAO15360 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCAO15360 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCAO15360 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCAO15360 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCAO15360 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCAO15360 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCAO15360 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCAO15360 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCAO15360 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCAO15360 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCAO15360 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FANCAO15360 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms