Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CEP290O15078 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP290O15078 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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CEP290O15078 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP290O15078 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP290O15078 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP290O15078 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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CEP290O15078 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP290O15078 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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CEP290O15078 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP290O15078 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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CEP290O15078 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP290O15078 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP290O15078 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP290O15078 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP290O15078 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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CEP290O15078 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP290O15078 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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CEP290O15078 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP290O15078 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP290O15078 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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CEP290O15078 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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CEP290O15078 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP290O15078 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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