Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNMO15061 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNMO15061 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNMO15061 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNMO15061 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNMO15061 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNMO15061 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNMO15061 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNMO15061 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNMO15061 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNMO15061 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNMO15061 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNMO15061 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNMO15061 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNMO15061 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNMO15061 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNMO15061 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNMO15061 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNMO15061 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNMO15061 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNMO15061 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNMO15061 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNMO15061 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNMO15061 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNMO15061 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNMO15061 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNMO15061 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNMO15061 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms