Protein–RNA interactions for Protein: H0Y7S4

PRAMEF26, Putative PRAME family member 26, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF26H0Y7S4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF26H0Y7S4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms