Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L13C9JLJ4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L13C9JLJ4 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L13C9JLJ4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L13C9JLJ4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L13C9JLJ4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L13C9JLJ4 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L13C9JLJ4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L13C9JLJ4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L13C9JLJ4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L13C9JLJ4 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L13C9JLJ4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L13C9JLJ4 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L13C9JLJ4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L13C9JLJ4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L13C9JLJ4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L13C9JLJ4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L13C9JLJ4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L13C9JLJ4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L13C9JLJ4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L13C9JLJ4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L13C9JLJ4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L13C9JLJ4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L13C9JLJ4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L13C9JLJ4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L13C9JLJ4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L13C9JLJ4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP17L13C9JLJ4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP17L13C9JLJ4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L13C9JLJ4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms