Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN25C9JDP6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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