Protein–RNA interactions for Protein: B4DLN1

cDNA FLJ60124, highly similar to Mitochondrial dicarboxylate carrier, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DLN1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DLN1 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DLN1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DLN1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DLN1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DLN1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DLN1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DLN1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DLN1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DLN1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DLN1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DLN1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DLN1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DLN1 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DLN1 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DLN1 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DLN1 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DLN1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DLN1 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DLN1 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms