Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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