Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms