Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms