Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
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