Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX8Q9Y5X2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms