Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms