Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
THRAP3Q9Y2W1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
THRAP3Q9Y2W1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
THRAP3Q9Y2W1 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
THRAP3Q9Y2W1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
THRAP3Q9Y2W1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
THRAP3Q9Y2W1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
THRAP3Q9Y2W1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
THRAP3Q9Y2W1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
THRAP3Q9Y2W1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
THRAP3Q9Y2W1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
THRAP3Q9Y2W1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
THRAP3Q9Y2W1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THRAP3Q9Y2W1 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms