Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms