Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms