Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms