Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB6

LIMA1, LIM domain and actin-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMA1Q9UHB6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LIMA1Q9UHB6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms