Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM5BQ9UGL1 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms