Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms