Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP2BPQ9P2M1 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP2BPQ9P2M1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP2BPQ9P2M1 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP2BPQ9P2M1 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP2BPQ9P2M1 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP2BPQ9P2M1 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP2BPQ9P2M1 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP2BPQ9P2M1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP2BPQ9P2M1 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP2BPQ9P2M1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP2BPQ9P2M1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP2BPQ9P2M1 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP2BPQ9P2M1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP2BPQ9P2M1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP2BPQ9P2M1 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRP2BPQ9P2M1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LRP2BPQ9P2M1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LRP2BPQ9P2M1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LRP2BPQ9P2M1 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LRP2BPQ9P2M1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LRP2BPQ9P2M1 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LRP2BPQ9P2M1 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms