Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9Q9P2J2 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms