Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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VAPAQ9P0L0 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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VAPAQ9P0L0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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VAPAQ9P0L0 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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VAPAQ9P0L0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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