Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMBRD1Q9NUN5 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms