Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPHK2Q9NRA0 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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