Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PFDN4Q9NQP4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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