Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ARFGAP3Q9NP61 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms