Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms