Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BPESC1Q9GZL8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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