Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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FOXQ1Q9C009 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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FOXQ1Q9C009 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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FOXQ1Q9C009 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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FOXQ1Q9C009 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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FOXQ1Q9C009 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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FOXQ1Q9C009 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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FOXQ1Q9C009 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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FOXQ1Q9C009 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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FOXQ1Q9C009 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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