Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM3Q9BZL3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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