Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC46A2Q9BY10 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC46A2Q9BY10 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms