Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXK1

KLF16, Krueppel-like factor 16, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF16Q9BXK1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF16Q9BXK1 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms