Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SORT1Q99523 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms