Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms