Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALPK3Q96L96 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALPK3Q96L96 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALPK3Q96L96 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALPK3Q96L96 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALPK3Q96L96 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALPK3Q96L96 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALPK3Q96L96 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALPK3Q96L96 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALPK3Q96L96 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALPK3Q96L96 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALPK3Q96L96 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALPK3Q96L96 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALPK3Q96L96 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALPK3Q96L96 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALPK3Q96L96 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ALPK3Q96L96 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 519.3 ms