Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD0

PDXP, Pyridoxal phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXPQ96GD0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDXPQ96GD0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms