Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM12Q96EX1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms